财务软件需要到财政局备案方可使用，有的代理记账单位没有采用财政部批准的财务软件来替代手工记账。 会计资料交接麻烦、不够规范。代理记账单位在接受委托单位的会计原始凭证及资料时，没有办理交接手续，发现遗失或毁损时无法查找。 代理记账单位通常是定期或定时上门服务，日常业务可通过电话沟通，会计不是随时在单位办理和咨询业务。
好处 、 费用节省，享用专业团队的服务。 第二、 运用计算机技术，，低差错率。 第三、 政府审批，专业正规，保障经济责任，免除企业后顾之忧。 第四、 避免因会计人员变动造成企业不必要的经济损失，同时也节省了专职会计住房、社会保险开支。 第五、 避免专职会计技能单一，影响会计质量。 第六、自身记账需要亲自填制、整理、分类、装订各类凭证；更需不时亲自到工商、税务部门办理业务。而代理记账，会比较省心。
一般，代理机构会提供以下业务： 1、整理原始单据、记账凭证； 2、出具财务报表（资产负债表、损益表）； 3、每月纳税申报及税款交纳，年度所得税汇算清缴； 4、新公司国地税报到等； 另外，有些机构可以提供免费的每月报税短信通知，邮件通知服务。
记账服务能为您解决以下问题： a. 使用电脑进行代理记账，能为您提供及时的财务会计信息，如：往来款明细;成本费用分项明细;当期损益等。 b.能长期稳定财务，可避免频繁更换公司的财会人员; c.能节约费用，支付代理记账费比招聘职员的费用低; d.代理记账比一般的财会人员更专业，做账时，有效的进行税收筹划降低纳税风险。 e.开具了发票的代理记账费用可全额在当年税前列支。